无痛肠镜也就是舒适肠镜，是逐渐推广的检查方法，但不是任何一个检查都适宜所有的人。
所以有部分群体不建议进行无痛肠镜的检查。这些群体包括精神异常的患者、完全昏迷的患者、体质非常差的患者、休克化体质非常弱，长期疾病，特别是消耗性疾病的患者都不适宜进行无痛检查。还有心脏功能异常的病人、肺功能异常的病人，特别是肺的换气功能很差，吸收消化能力差的患者，这些都不能进行无痛肠镜检查。
无痛肠镜检查不是操作时无痛，而是操作前使用麻醉药物以后，阻断病人的疼痛感觉，而进行的检查。因此对昏迷、体质差、不能耐受麻药、麻药过敏的患者都不能进行无痛肠镜的检查。
