坚持用科学发展观、构建社会主义和谐社会、建设创新型国家、建设社会主义新农村、树立社会主义荣辱观、加强党的执政能力建设、加强党的先进性建设等党的一系列理论创新成果武装干部、教育职工。
部党组中心组先后组织了5次专题学习，就推进和谐铁路建设进行深入研讨，充分发挥了科学理论的引导作用。加强领导班子和人才队伍建设，制定下发《铁路局领导班子集体决策“三重一大”问题的规定(试行)》，促进了重大问题决策的科学化和民主化。
选好配强各级领导班子党政正职，大胆使用优秀年轻干部，进一步优化了各级领导班子结构。加强干部和人才培训工作，2006年铁道部直接培训领导干部1336人、技术骨干8500多人、客运专线运营人才430多人。调整企业党组织设置，建立精干高效的政工机构和政工队伍。
巩固和扩大保持共产党员先进性教育活动成果，制定下发《关于保持和发展党的先进性，加强和改进铁路企业党建工作的意见》，深入开展学习党章、遵守党章、贯彻党章、维护党章活动，深化创建党支部“安全屏障”工程活动，促进了基层党组织建设。
深入开展社会主义荣辱观教育，在全路组织开展了“知荣辱、树新风，争当精神文明建设火车头”主题实践活动，促进了职工思想道德素质的提高。
围绕青藏铁路通车等重点工作，强化正面宣传，为和谐铁路建设营造了良好舆论环境。抓好选树典型工作，一批代表新时期铁路职工精神风貌的先进集体和个人在路内外广泛宣传。
以领导干部廉洁自律和重点领域源头治理为重点，积极推进铁路惩治和预防腐败体系建设，加强廉政教育，认真开展治理商业贿赂工作及执法监察和专项检查，查处了一批违法违纪案件和损害旅客货主利益的路风问题，铁路党风廉政建设和反腐败工作取得新成效。
