由中铁十一局集团有限公司承建的马鹿箐隧道，地处清江源头地带的深山峡谷之中，右线长7879米、左线长7836米，需要穿越数不清的特大富水隐伏溶腔、岩溶峡谷、煤层、天坑、溶缝、落水洞、断层破碎带、地下暗河和山中暗湖等特殊地质带，被称之为建筑在地下长江上的隧道。
施工中，铁道部和宜万铁路建设指挥部多次组织国内地质、水利、煤炭、土木工程等领域的院士、专家调查会商，研讨通过溶腔、治理水患的方案，经过反复论证比选、优化调整，研究制订了“排水减压、注浆固结、超前支护、暗挖通过”的施工方案。施工单位采用当代先进的探测仪器和科学的超前地质预测预报手段，在过岩溶高压富水段堵水施工技术和突水突泥治理施工研究等技术研究方面取得了历史性突破。
