20日下午，广州、深圳机场分别遭遇强雷雨天气袭击，两地机场分别启动航班大面积延误预警，受此影响，两地机场出现大面积航班延误。截至19：30，白云机场延误1小时以上航班76班，延误时间最长的航班是CZ6322，延误6小时34分。备降至周边机场的有20班，因雷雨取消的出港航班22班，进港航班12班。
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当日下午14：54，中等强度对流云团开始给白云机场带来雷阵雨，导致延误1小时以上航班达到31班，14：54，白云机场启动了蓝色大面积航班延误应急预警。15：02分，延误1小时以上航班达到了50班，航班延误应急预警升级至黄色。机场各单位启动了相应的应急预案，严格按照预案，全力做好延误航班的保障和受影响旅客的服务。17：00至18：00之时，正值平日航班的高峰时段，但是猛烈的雨势导致一小时内白云机场实际出港航班仅4班，实际进港航班仅10班，仅为平日航班量的20%左右。
来自南航方面的消息称，其广州总部于16:30启动航班大面积延误“黄色预警”，南航深圳分公司于18:30启动了航班大面积延误“蓝色预警”。截至20日19:00，南航两地进出港共计延误130班，备降17班，取消16班。
目前，航站楼内秩序良好，白云机场通过楼内广播、LED屏、航班显示屏、问询电话等，不间断为旅客提供航班指引。机场方面为代理航班的延误旅客及时安排住宿以及提供餐饮，各大航空公司工作人员也正紧张地在为旅客办理改签退票手续。目前白云机场及周边机场天气开始好转，小雨为主，航班放行速度持续增加，前往华东、京广线和西南航班有短时流控。
