嵩屿码头作为厦门岛外一个较为成熟的旅游码头，“嵩屿码头—鼓浪屿内厝澳码头—第一码头”航线定位为旅游与城市公共交通相结合的航线，主要承接漳州、龙岩、赣南、珠三角等进入厦门的游客和岛内外往来市民。目前，鼓浪屿内厝澳码头至海沧嵩屿码头首班航班时间为7:15，每间隔1小时1班，末班时间为18:15，嵩屿码头至内厝澳码头首班时间为7:30，每间隔1小时1班，末班时间为18:30。
据了解，海旅集团正加快推进包括旅游综合管理服务大楼及配套、游客集散广场、停车场等设施的嵩屿码头客运中心项目建设，同时已向港口管理局申请，力争将该航线通航班次间隔时间由1小时缩短至20-30分钟每班。
