昌平线一期沿线有沙河高教园、生命科学园等客流聚集区。自2010年12月30日昌平线一期正式开通运营后，客流量持续增加，初期设定列车运行间隔均为10分钟。
西二旗站是地铁13号线与昌平线一期的换乘站。晚高峰时，13号线最小发车间隔为3分钟，而昌平线一期的发车间隔为10分钟。这样的“差距”使得西二旗站的换乘客流淤积明显。为缓解昌平线一期晚高峰时段客流压力，满足乘客需求，2011年11月，昌平线一期调整列车运行间隔，平日晚高峰列车运行间隔由10分钟调整为6分30秒；2012年3月，昌平线一期平日早高峰列车运行间隔也由10分钟缩短至8分30秒，运力提高17.6%。
从今年5月6日起，昌平线一期再次缩短列车运行间隔。按照最新列车运行图的安排，昌平线一期平日早高峰时段最小间隔缩短两分钟，由8分30秒调整至6分30秒，晚高峰则缩短一分钟，由6分30秒调整至5分30秒。
自从轨道交通昌平线开通以后就选择乘坐其上班的韩先生，每天早上7点半左右都会在沙河高教园站候车。5月6日早上，他惊喜地发现，排队候车的人明显减少了，乘车也明显感觉没那么拥挤了。
有关负责人表示，今后，昌平线还将根据客流量的增加，适时调整发车间隔，方便更多市民出行。
