经过多年的使用，琼州大桥难免出现损伤。据介绍，琼州大桥处海洋环境，钢管拱吊杆PE索套在环境和高应力综合作用下老化开裂，下锚头在汽车荷载反复作用下疲劳有渗水现象；钢管拱红色面漆老化泛白；由于混凝土的干缩，钢管拱拱背有脱空现象，属钢管混凝土系杆拱桥通病。此外，由于当初受建设投资条件等因素限制，琼州大桥桥宽仅23米，行车道、非机通道、人行道宽度不足问题日渐突出，桥梁构件被碰损伤或磨损，如钢管拱两侧、护栏、局部桥面等。
为防止桥梁安全事故发生，交通运输部每年对全国每个省市抽检一座特大桥，琼州大桥是其中之一，并要求在今年必须完成维修加固。为此，海南省交通运输厅批复投资1304万元。对于此次加固工程，省公路管理局表示，该桥2003年建成通车以来除正常养护外仅对引桥桥面进行了局部小修保养；按此次维修加固的内容、规模和时间，根据交通运输部养护工程定义为正常大中修工程。
