在铁道部改革的消息公布后，广州铁路公司人士向媒体表示，现在集团所有员工都是企业编制，未来应该不存在政企分开的问题。
作为18个路局之一，广铁集团是我国首个“公司化”的铁路局。改制之后，广铁集团旗下的部分铁路票价一度被外界冠以 “全国最贵”。
自1982年铁道部宣布对下属路局放权让利以来，中国铁路系统的渐进式改革已历近30年。与其他经济部门的改革类似，政企分开始终是铁路改革的主线和方向。
继广深铁路以每公里0.548元的均价登上“全国最贵铁路”的位置后，2013年元旦前一天，全线贯通的广珠城轨宣布涨价，涨价后以每公里均价为0.598元成为新的“全国最贵铁路”。然而即便如此，今年1月，有媒体援引一些地方路局人士的话，2012年广铁集团可能亏损26亿元。
去年11月份，广州当地的媒体《晶报》报道，同样是动车，珠海北到广州南票价只要36元，而深圳到广州却要75元。记者随即采访了广铁集团相关负责人，但未获回应。有业内人士分析指出，广深是上市公司属企业，但广珠则是“准公益性质”的轻轨。
据记者调查，广深铁路由广深铁路股份有限公司经营，广珠城轨则由广珠城际轨道交通有限责任公司经营，两者虽然同属广铁集团，但前者是“中国铁路目前唯一一家在内地、香港和纽约挂牌上市的股份制企业”，而后者则由铁道部和广东省各出资50%，沿线的佛山、中山、珠海等各市以征地拆迁费用作价入股，“性质不同”。
“城轨”一般都是“准公益性质”，而上市公司经营铁路则是“纯企业性质”。前者因为有公益性质，往往享受特殊政策或补贴，其票价需要经过听证会来确定；而后者相对来说享有更多的定价自主权。广深铁路公司作为“纯企业性质”公司，根据《国家计委关于广深铁路运价的复函》“在国家规定的浮动幅度内由企业自主定价”，此前曾据此上浮票价5元并按规定上报备案。
11日，参加广东团审议国务院机构改革和职能转变方案的全国人大代表、广州铁路公司董事长、总经理李文新对于铁道部被撤销一事不愿发表过多评论。对于火车票是否会上涨，他表示“火车票市场定价”最后还得经过国家批准，人员上也不会有什么变化。
