杨传堂对此的理解是：“现在，我国综合交通运输体系已基本形成，通过这次改革，将掀开新的一页。”
此番话是杨在十二届人大一次会议的闭幕会结束后走出北门被记者堵上之后说的。他并称：“中国铁路总公司成立之后，原铁道部的903名公务员将进行分流，有些进入该公司，有些进入交通运输部、国家铁路局，还有部分将进入地区局，具体分流的方案尚未确定。另外，偏远地区的高铁项目会继续上马。”
从公开言论来看，杨传堂似乎对铁道部并入交通运输部之后的管理难度担心不大，对综合交通运输体系的建设也信心满满。
一位接近铁道部机构改革方案制定的内部人士说，当时为改革提供了三套方案，大方案是将所有与交通有关的部门都归并到交通运输部，其中包括发改委的基础产业司，然而，由于受到阻力太大，该方案未能实行。
而交通运输部与此前并入的民航总局的关系，也未见得“如鱼得水”，该人士称，实际上，民航总局的一些文件，尤其是重要文件，都直报国务院，未通过交通运输部上报，一开始交通运输部还抗争一下，后来也就默认了。
有鉴于此，未来铁路管理局与交通运输部的上下级管理关系如何厘清，尚须拭目以待。
