沈阳铁路局在构建多元化经营、一体化管理、全口径核算运行机制中，不断加大审计工作的力度，追踪审计问题的整改，加强审计基础工作的建设，为企业规范管理、防范经营风险、维护经营秩序提供有力的监督保障。
在审计监督中，沈阳局确立了 突出重点、强化监督、规范管理、服务大局的指导思想，并把强化内控制度的有效性、提高企业的 免疫力作为重点工作。
经营业绩的审计是审计工作的重中之重。沈阳局签订责任状的单位涵盖了68个运输站段、12个运输辅助单位和22个非运输企业，数量多、范围广。为高质量地完成审计工作，沈阳局审计部门每年都要提前研究确定审计重点内容，整合资源，集中时间平行推进开展审计工作。
为确保建设资金的合法依规使用，沈阳局审计部门积极开展工作，于2011年集中审计了铁道部管建设项目哈大铁路客运专线配套工程涉及的沈阳站改造等10个项目，并对代建的哈大铁路客运专线大连站站房等4个工程项目以及内蒙古东部铁路、长双烟铁路有限公司等的收支情况进行了审计。
同时，沈阳局审计部门还在加强审计监督的规范化建设、经济责任审计、资金安全审计、资产专项审计、专项审计调查、经营管理审计、审计问题整改等方面大力开展工作，不断完善审计监督的管理和约束机制。
仅2011年，沈阳局就完成各类审计工作186项，审计部门提出审计处理建议655条，被采纳率达到99.7%。
