面对近期陆续出现的本地新冠肺炎疫情新增病例情况，上海地铁在原有疫情防控措施的基础上，进一步巩固强化各项措施。
2021年1月26日，在上海市新冠肺炎疫情防控新闻发布会上，申通地铁集团副总裁邵伟中向媒体介绍了地铁方面最新的防控措施。
邵伟中表示，所有进站人员均需规范佩戴口罩，所有进站人员必须测温；所有车站恢复隔离区设置。如遇测温高于37.3℃的乘客应立即引导至隔离区进行二次测温，二次测温仍发现异常的及时通知疾控部门并配合做好后续移送转诊工作。
此外，上海轨道交通11号线昆山段已启动入沪乘客进站验码措施；10号线二期、18号线一期、15号线开通后，共459座车站，设立871处测温点，全部配备热成像仪，口罩机905台，确保所有车站费区外至少一台。
上海轨道交通加大宣传力度，利用广播、乘客信息显示系统、车站大屏、三色实时客流显示系统、公告栏等各类宣传阵地发布信息，做好车厢内规范佩戴口罩的广播提示和执法巡查。
站车防疫措施方面，邵伟中透露，上海地铁全网门户车站16座中，乘客频繁接触设施设备（安检设备、自助售票机、闸机等）消毒每小时1次，易接触设备（楼梯扶手、电扶梯扶手、公共卫生间门把手等）及接触区域（出入口、站台、站厅、公共卫生间等）每4小时1次。车站通风模式采取全新风模式，通风时长在运营时段前后各增加1小时。空调滤网消毒频次（或更换滤网频次）每3-5日消毒一次（或每15日更换1次）。
枢纽换乘、大客流等48座车站中，乘客频繁接触设施设备消毒每4小时1次，易接触设备及接触区域每6小时1次。车站通风模式采取全新风模式，通风时长在运营时段前后各增加0.5小时。空调滤网消毒频次（或更换滤网频次）每5-7日消毒一次。
其他车站里，乘客频繁接触设施设备、易接触设备及接触区域消毒每日2次。车站通风模式及通风时长采取正常工况。空调滤网消毒频次按常规修程执行。
列车消毒频次按每日回库后全面消毒1次，包括车厢内拉手、立柱、扶手、车门等乘客易接触部位。
同时，公共卫生间配备洗手液供乘客清洁使用。
邵伟中表示，上海地铁已与机场、铁路等城际大交通建立了疫情防控联动机制，一旦出现突发情况，将采取联动管控措施，以保障安全。
邵伟中同时表示，地铁将加强对重点车站、区段的客流监控，对全网各车站做到动态管控、精确限流、灵活调整行车和客运组织，尽可能降低车站和车厢乘客拥挤程度，同时限流车站排队时间均控制在5分钟以内，达到疫情防控和大客流管控“两手抓、两不误”。
上海地铁方面还会关注新线开通后首个春运的客流引导等工作，备好应急预案，做好如缩线、跳站等应急措施的联动处置工作。邵伟中透露
