为了适应网络化建设的要求，实现管理职能的转变，经过半年的酝酿和筹备，南京地下铁道有限责任公司建设分公司于2007年8月28日正式挂牌成立，总公司朱自强总经理为新成立的建设分公司揭牌。
建设分公司的成立，是总公司进一步深化改革，强化管理和提升发展迈出的重要一步，标志着具有南京地铁特色的“三位一体”发展格局已经基本成型，也标志着建设分公司在这个格局中担负的重要任务。建设分公司的成立是总公司对内部结构和管理层面进行的一次重大调整和完善，是总公司面对当前复杂的建设形势、繁重的建设任务作出的重要决策。为了体现建设分公司的职能和重要位置，总公司赋予了建设分公司更全的职能，将建设的所有职能全部归口到建设分公司，通过分公司职责的履行，来实现南京地铁“三位一体”格局中着重是做好建设的这一层面。
