地铁5号线工程线路全长53.4公里，全为地下线，设车站38座，其中换乘站15座，设杭州地铁5号车辆基地1座(仓前车辆基地)、停车场1座(萧山停车场)，控制中心共享地铁1号线建华控制中心。主变电站除利用1号线火车东站主变外，新建主变电站2座(三坝村站、江南大道站附近)。 西起老余杭，经仓前街道(余杭区)、三墩街道、浙大紫金港、申花(西湖区)、桥西、拱宸桥街道(拱墅区)、运河商贸中心、石桥街道、东新街道、和平广场(下城区)、艮山门、经建国路至城站火车站枢纽，再沿江城路转望江门(上城区)、雄镇楼、至飞云江路口，经隧道过江，至滨江区江南大道，沿长河路至长河街道(滨江区)，再转向滨康路、新汽车南站，沿金城路、人民广场(萧山区)，至杭州火车南站枢纽，往东至新街镇，并预留瓜沥组团轻轨接口。杭州地铁5号为杭州城市轨道线网中的主干线之一。
杭州地铁5号余杭区段预留有向西连接临安市的城市圈轻轨接口。
