广深线动车组已经全程实现公交化，旅客持当日车票可乘任何一趟列车。车票有效期为“当日使用一次有效”。
不过，铁路部门提醒，根据广深铁路乘车有关规定，乘广深线动车组的旅客，持车票乘车自发站进入闸机至到站出闸，一次全程旅行时间3小时内有效，凡超过3小时的视为无效车票，车站按无票处理。如：旅客在广州东站乘车往深圳站，列车9：20开，旅客9：00持蓝色磁质车票、金融IC卡、身份证、快通卡进入闸机进站乘车，至12：00前该票有效。
目前广州东至深圳间动车组除开行2对直达列车外，其余均在石龙、东莞、樟木头站办理客运业务。
